Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms