Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa35E9QLQ1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa35E9QLQ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms