Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms