Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms