Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FancfE9Q5Z5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FancfE9Q5Z5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms