Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms