Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pgbd1E9Q492 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms