Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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ApobE9Q414 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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ApobE9Q414 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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ApobE9Q414 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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ApobE9Q414 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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ApobE9Q414 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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ApobE9Q414 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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ApobE9Q414 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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ApobE9Q414 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
ApobE9Q414 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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ApobE9Q414 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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