Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms