Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ccdc171E9Q1U1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ccdc171E9Q1U1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ccdc171E9Q1U1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Ccdc171E9Q1U1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Ccdc171E9Q1U1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Ccdc171E9Q1U1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Ccdc171E9Q1U1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Ccdc171E9Q1U1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc171E9Q1U1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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