Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3250E9Q1M3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms