Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myo5cE9Q1F5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myo5cE9Q1F5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myo5cE9Q1F5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Myo5cE9Q1F5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myo5cE9Q1F5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myo5cE9Q1F5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5cE9Q1F5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms