Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms