Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms