Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r177E9PXM3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms