Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Srp54bE9PXC0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Srp54bE9PXC0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Srp54bE9PXC0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Srp54bE9PXC0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Srp54bE9PXC0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Srp54bE9PXC0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Srp54bE9PXC0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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