Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms