Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms