Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hfm1D3Z4R1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms