Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms