Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms