Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms