Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms