Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC048679D3YXE9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC048679D3YXE9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC048679D3YXE9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC048679D3YXE9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC048679D3YXE9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC048679D3YXE9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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BC048679D3YXE9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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BC048679D3YXE9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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BC048679D3YXE9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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BC048679D3YXE9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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BC048679D3YXE9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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BC048679D3YXE9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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BC048679D3YXE9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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BC048679D3YXE9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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BC048679D3YXE9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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