Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms