Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cttnbp2B9EJA2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms