Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd8B9EJ80 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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