Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms