Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms