Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfia4B8QI36 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfia4B8QI36 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfia4B8QI36 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms