Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm20547B8JJN0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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