Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms