Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms