Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rd3lB2RV38 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms