Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm4787B2RUD9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm4787B2RUD9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm4787B2RUD9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm4787B2RUD9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm4787B2RUD9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm4787B2RUD9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm4787B2RUD9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4787B2RUD9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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