Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt4B2RU40 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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