Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms