Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms