Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brpf1B2RRD7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms