Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdc2B2RR83 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc2B2RR83 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms