Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms