Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU022751B1B0V2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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