Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms