Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl41A2AUC9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms