Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Patl2A2ARM1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Patl2A2ARM1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms