Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms