Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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