Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r2A2AMT6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms