Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cavin4A2AMM0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cavin4A2AMM0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms