Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl2A2AGA4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms